NGS – Next Generation Sequencing

 

 

Next Generation Sequencing NGS

 

Das NGS ist eine innovative Technik, deren Einsatz bei vielen heterogenen Krankheitsbildern helfen kann, deren Ursache eindeutig zu klären.

 

Bei der Anwendung ist zu berücksichtigen, ob die relativ aufwendige, d.h. teure Diagnostik auch klinische Konsequenzen hat.

 

Die Kommission „Diagnosebezogene Abrechnungsmodelle“ der GfH hat deshalb in Zusammenarbeit mit der Kommission Gebührenordnung des BVDH Indikationen für den Einsatz der NGS erarbeitet.

 

 

Erkrankung	Indikation	Stufendiagnostik
Sensorineurale Hörstörungen	Eine fachärztliche Untersuchung (FA f. Phoniatrie und Pädaudiologie oder FA f. HNO mit pädaudiologischer Expertise) ist erfolgt. Eine Dokmentation der Krankengeschichte, das Ergebnis eines objektiven Hörtests, z.B. Auditory brain stem response testing (ABR bzw. BAER, BSER) und der Familienanamnese liegt vor.	zunächst Ausschluss einer Mutation in GJB2 und einer  Deletion in GJB6
	Ausmaß und Qualität der Hörstörung lassen mit hoher Wahrscheinlichkeit eine Störung der Sprachentwicklung erwarten oder haben dazu geführt.
	Ursachen für erworbene Hörstörungen sind –so weit möglich- ausgeschlossen worden, beispielsweise pränatale "TORCH" Infektionen (Toxoplasmose, Röteln, Cytomegalie und Herpes), Meningitiden, Tumoren, Entzündung).
	Gestattet die Familienanamnese den Rückschluss auf einen Erbgang, besteht eine Indikation nur für das entsprechende Sub-panel.
	Gestattet die Familienanamnese keinen Rückschluss auf einen Erbgang, besteht zunächst eine Indikation nur für das Sub-panel autosomal-rezessiv.
Epilepsie	Therapierefraktäre/ therapieschwierige Epilepsie, generalisiert oder fokal, Beginn vor dem vollendeten dritten Lebensjahr	vor NGS obligat Array-CGH zum Ausschluss ursächlicher CNV
	obligat fachärztliche klinisch-genetische Syndromdiagnostik unter Berücksichtigung der klinischen Befunde entsprechend EBM GOP 11232 (neu 11234), ohne Hinweis auf spezifische monogene syndromale Erkrankung
	Das Vorliegen eines der folgenden Kriterien sowie weitgehender Ausschluß einer exogenen (i. e. infektiösen oder traumatischen) Genese, Indikationsstellung durch Neurologen, Neuropädiater oder Humangenetiker mit schriftlicher Dokumentation zu Krankheitsverlauf und Familienvorgeschichte):
	unklare syndromale Erkrankung mit Krampfanfällen
	epileptische Enzephalopathie mit Beginn im 1. Lebensjahr oder schwerer myoklonische Epilepsie der frühen Kindheit (Dravet/SMEI/GEFS+)	hierbei zunächst Ausschluss einer SCN1A-Mutation
Angeborene strukturelle Hirnfehlbildungen	Im cMRT prä- und/oder postnatal dokumentierte angeborene strukturelle ZNS-Fehlbildung entsprechend einer der unten aufgeführten Subpanelkategorien:
	isoliert oder gemeinsam mit weiteren strukturellen Fehlbildungen des ZNS oder extrazerebral
	bei Kindern ab dem vollendeten 2. Lebensjahr obligat psychomotorische Entwicklungsverzögerung und/oder Anfallsleiden dokumentiert durch Neuropädiater
	bilaterale cortexisodense periventrikuläre noduläre Heterotopien, mindestens 2 pro Seite
	bilaterale cortexisodense Bandheterotopien
	bilaterale Pachygyrie incl. klassischer Lissenzephalie oder Pflasterstein-Lissenzephalie, generalisiert oder frontal betont oder occipital betont	bei generalisierter oder occipital betonter klassischer Lissenzephalie vorher obligat Ausschluss LIS1(PAFAH1B1)-Deletion mittels MLPA oder Miller-Dieker-FISH und obligat Sequenzierung LIS1(PAFAH1B1)-Gen
		bei Knaben oder Feten mit Karyotyp 46,XY und generalisierter oder frontal betonter klassischer Lissenzephalie vorher obligat Ausschluss DCX-Mutation mittels MLPA und Sequenzierung
	neuronale Organisationsstörung als Polymikrogyrie oder PMG-ähnlich, symmetrisch oder ausgedehnte PMG asymmetrisch cMRT-Bildgebung nicht typisch für fokale cortikale Dysplasie (FCD)	vor NGS obligat Array-CGH zum Ausschluss ursächlicher CNV und sofern vorhanden peripartale Infektionsdiagnostik ohne Hinweis auf ursächliche häufige Erreger intrauteriner Infektionen (falls möglich TORCH)
	Holoprosenzephalie	obligat HPE-MLPA oder Array-CGH, bei pos. Familienanamnese und/oder singulärem oberem Schneidezahn zunächst obligat Ausschluss Mutation SHH-Gen und SIX3-Gen mittels Sequenzierung
	congenitale Mikrozephalie mit Kopfumfang prä- oder perinatal kleiner/gleich -3 SD	vorher obligat Array-CGH zum Ausschluss ursächlicher CNV und Chromosomenanalyse
	syndromale strukturelle Hirnfehlbildungen unklassifiziert, ggf. auch metabolisch oder mitochondrial bei Kindern nach dem 2. Lebensjahr obligat  tiefgreifende psychomotorische Entwicklungsverzögerung und/oder therapieschwierige Epilepsie, fachärztlich neuropädiatrisch dokumentiert	obligat fachärztliche klinisch-genetische Syndromdiagnostik unter Berücksichtigung der klinischen Befunde entsprechend EBM GOP 11232 (neu 11234) ohne Hinweis auf spezifische monogene syndromale Erkrankung
Prolongierte frühkindliche und juvenile Cholestase	gesicherte Diagnose einer frühkindlichen/juvenilen Cholestase durch bildgebenden Verfahren (Sonographie und/oder MRT/CT/ERCP) und Leberhistologie (außer bei klinischer Kontraindikation für eine Biopsie) und obligat richtungsweisender laborchemischer Befundkonstellation und gleichzeitig weitgehendem Ausschluss einer infektiösen, autoimmunen und onkologischen Ursache derselben
	kongenitale Gallensäuresynthesedefekte: Richtungsweisende laborchemische Befundkonstellation, insbesondere selektiv erniedrigte Gallensäuren im Plasma und Auffälligkeiten bei der Analyse der Gallensäuren im Urin
	Peroxisomale Erkrankungen/Hepatopathie mit neurologischer Symptomatik: zusätzlich neurologische Symptomatik und/oder auffällige wegweisende ZNS-Bildgebung und/oder auffällige richtungsweisende Labordiagnostik in einem spezialisierten Stoffwechsellabor
	Hepatopathien mit Ciliendyskinesie / kongenitale hepatische Fibrose: im Leberbiopsat Hinweis auf Duktalplattenmalformation und/oder nephrologische Beteiligung (z.B. Nierenzysten) und/oder Lateralisationsstörungen (Heterotaxie, z.B. Situs inversus)
	Cholestatische Erkrankungen durch Mitochondropathie: vorher obligat fachärztliche pädiatrisch- gastroenterologische Untersuchung plus entweder typische laborchemische Befundkonstellation für Mitochondropathie (z.B. erhöhtes Laktat) oder zusätzliches Vorliegen richtungsweisender neurologischer Symptome (z.B. Myopathie, Sehstörungen, Hörstörungen, Epilepsie, Ataxie)
	Progressive Familiäre Intrahepatische Cholestase (PFIC) erniedrigte oder normale GGT-Werte im Serum bei intrahepatischer Cholestase
	Cholestaseerkrankungen mit Gallengangshypoplasie Leberhistologie: verminderte Anzahl der Gallengänge und klinischer Hinweis auf syndromale Grunderkrankung (z.B. Alagille-Syndrom)
	unklassifizierte prolongierte frühkindliche und/oder juvenile Cholestase, ggf. auch mit zusätzlichen Organfehlbildungen, auch syndromal, metabolisch oder mitochondrial: vorher obligat fachärztliche pädiatrisch- gastroenterologische Untersuchung und klinisch-genetische Syndromdiagnostik unter Berücksichtigung der klinischen Befunde entsprechend EBM GOP 11232 (neu 11234) ohne Hinweis auf spezifische syndromale oder monogene  Erkrankung, die kostengünstiger mittels anderen Untersuchungsmethoden erfasst werden kann (z.B. Morbus Wilson, Morbus Meulengracht, CF)
Erbliche Netzhaut-dystrophien	Indikationsstellung für Indexpatient in der Familie durch Facharzt für Augenheilkunde mit Dokumentation seitengleicher bilateraler Netzhautläsionen anhand richtungsweisender Befunde der retinalen Bildgebung (Ophthalmoskopie, Fundusautofluoreszenz, hochauflösende Optische Kohärenztomographie)  und/oder der retinalen Funktionsdiagnostik (ERG, Flicker, EOG).  Bei Krankheitsbeginn Abgrenzung zentraler Netzhautdystrophien (Morbus Best, X-gebundene juvenile Retinoschisis) von generalisierten Zapfen- Stäbchendystrophien (Hinweis auf Verlauf der Erkrankung).  Abgrenzung stationärer  von progredienten Formen der Netzhautdystrophien.  Obligat vorher Ausschluss erworbener Formen einer Netzhautdegeneration.	Bei typischer Befundkonstellation für eine Norrie-Erkrankung obligat vorher molekulargenetischer Ausschluss NDP-Mutationen mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung und ggf. MLPA.
	In begründeten Ausnahmefällen bei Verdacht auf X-gebundenem rezessiven Erbgang und fehlendem Untersuchungsmaterial eines männlichen Indexpatienten auch Untersuchung weiblicher Risikopersonen mit fehlender klinischer Manifestation bei bekannter reduzierter Penetranz und variabler Expressivität.
	bilaterale Retinitis pigmentosa
	bilaterale Zapfen-Stäbchen-Dystrophie
	Kongenitale Leber Amaurose
	Usher Syndrom obligat Retinitis pigmentosa mit progredienter Hörminderung ohne Beeinträchtigung des vestibulären Systems
	Bardet-Biedl Syndrom obligat Rod cone-Dystrophie und mindestens 2 weitere extraretinale Manifestationen wie Polydaktylie, mentale Retardierung, Stamm-Fettleibigkeit mit Gewicht > P97, Nierenfehlbildungen und/oder Nierenfunktionsstörungen
Skelettdysplasien	Obligat prä- bzw. perinatal oder bis zum vollendeten 5. Lebensjahr richtungsweisende biometrische Befunde incl. symmetrisch dysproportioniertem Körperbau und/oder Knochenstruktur, obligat verifiziert in Bildgebung mittels pränatalem Ultraschall und/oder fetalem MRT oder obligat postnatal mittels Röntgendiagnostik/CT und ggf. histologischer Befunde post mortem.
	isoliert oder gemeinsam mit Fehlbildungen außerhalb des Skelettsystems
	bei jeder vorgeburtlichen Diagnostik obligat Befundsicherung durch Organultraschall entsprechend Qualifikation DEGUM II oder III
	ggf. auch an Untersuchungsmaterial eines auffälligen Feten oder verstorbenen Indexpatienten, in begründeten Ausnahmefällen auch bei der Mutter des Indexpatienten oder anderen Angehörigen 1. Grades bei konkretem Kinderwunsch
	Chondrodysplasien prä- oder perinatal mit oder ohne Thoraxdystrophie	bei Rhizomelie und/oder engem Thorax vorher obligat Ausschluss spezifische Hotspot-Mutationen in FGFR3 für Achondroplasie und/oder Thanatophore Dysplasie
	Skelettdysplasien mit multiplen Gelenk-Luxationen
	Osteogenesis imperfecta und andere Skelettdysplasien mit verringerter Knochendichte
	Skelettdysplasien bei Mukopolisaccharidosen und anderen Speicherkrankheiten
	Skelettdysplasien mit erhöhter Knochendichte
	Syndromale Skelettdysplasien mit mindestens einer zusätzlichen strukturellen Organfehlbildung (z.B. renal, kardial, cerebral): vorher obligat fachärztliche pädiatrische und/oder pränatalmedizinische Diagnostik und Dokumentation der zusätzlichen Organfehlbildungen mittels bildgebender (z.B. Ultraschall, MRT) und ggf. Funktionsdiagnostik und obligat fachärztliche klinisch-genetische Syndromdiagnostik unter Berücksichtigung der klinischen Befunde entsprechend EBM GOP 11232 (neu 11234)
Schwere primäre Immundefekte im Kindesalter	fachärztliche pädiatrisch-hämato-onkologische Untersuchung mit richtungsweisender laborchemischer/hämatologischer Befundkonstellation und ggf. typischem Befund im Knochenmarkspunktat  sowie weitestgehendem Ausschluss exogener ursächlicher Faktoren oder monogener syndromaler Formen, welche kostengünstiger mit anderen Verfahren incl. Sanger-Sequenzierung diagnostisch zu sichern sind.
	Nicht-immunologisch bedingte Zytopenien bzw. aplastische Anämien
	Persistierende Zytopenie einer oder mehrerer hämatologischer Zellreihen nachgewiesen in mindestens 2 unabhängigen Untersuchungen mit oder ohne klinische Manifestation.
	Immunbedingte Zytopenien bzw. aplastische Anämien
	Verdacht auf Immun-Zytopenie einer oder mehrerer hämatologischer Zellreihen mit oder ohne klinische Symptomatik bei typischer laborchemischer/hämatologischer Befundkonstellation und typischem Knochenmarkspunktat und ohne morphologischen Hinweis auf hämatopoetische Insuffizienz (DD: Aplastische Anämie).
	Fakultativ Nachweis anderer autoimmunologischer Reaktionen in diversen Zielorganen. Fakultativer Nachweis  CD4-/CD8- T-Zellen
	Schwere kongenitale Immundefekte (SCID)
	obligat wiederholte untypisch schwere Infektionen antibiotisch und/oder stationär behandlungsbedürftig und zusätzlich mindestens ein weiteres fakultatives Kriterium:
	Fakultativ: klinisch manifeste Infektion mit opportunistischen Krankheitserregern (Pneumocystis carinii, Mykosen o.ä.) und/oder zusätzliche Autoimmunphänomene (Ekzem, Arthritiden, Thrombozytopenien, hämolytische Anämie u.a.) und/oder Zytopenien einzelner Zellreihen und/oder typische Ergebnisse in der Flowzytometrie. Ggf. zusätzliche angeborene Fehlbildungen und/oder psychomotorische Entwicklungsverzögerung.
Muskel-erkrankungen	Klinische Manifestation mit Onset vor dem 30. Lebensjahr und progredientem Verlauf,
	Indikationsstellung durch Neurologen, Neuropädiater oder Humangenetiker mit schriftlicher Dokumentation (Krankheitsverlauf, Familienvorgeschichte),
	Erworbene Ursachen (z. B. Entzündung) sind differentialdiagnostisch ausgeschlossen
	Sofern eine Muskelbiopsie bereits erfolgt ist: Nachweis eines myopathischen Gewebesyndroms. Histologische und immunhistologische Untersuchung liefern keinen konkreten Hinweis auf die genetische Ursache,
	Ausschluss von Mutationen des DMD-Gens bei V. a. X-chromosomale Muskeldystrophie
	Ausschluss von Mutationen am FSHD1-Locus bei Beteiligung des Schultergürtels
Hereditäre Neuropathien, spinale Muskelatrophien	Es ist eine fachärztliche neurologische oder neuropädiatrische oder pädiatrische Untersuchung erfolgt, aufgrund derer die Diagnose einer peripheren Neuropathie oder einer spinalen Muskelatrophie bzw. Motoneuropathie mit fakultativer Beteiligung des 1. Motoneurons gestellt wird. Ein schriftlicher Bericht dokumentiert die Familienanamnese, die individuelle Krankengeschichte, den Neurostatus sowie Voruntersuchungen.	Ausschluss einer CMT Typ IA aufgrund einer Deletion des PMP22-Gens bei demyelinisierender Polyneuropathie;
	Es liegt eine positive Familienanamnese vor	Ausschluss einer Duplikation des PMP22-Gens beim Phänotyp der „hereditären Neuropathie mit Neigung zu Druckparesen" (HNPP)
	ODER	Ausschluss einer Deletion des SMN1-Gens  bei klinischem Verdacht auf eine SMA Typ I-III
	es liegt eine Manifestation in den ersten 10 Lebensjahren vor	Ausschluss einer Repeat-Expansion des C9ORF72-Gens bei einer Motoneuropathie mit Beteiligung des 1. und 2. Motoneurons
	ODER
	es liegt eine Manifestation nach dem 10. Lebensjahr vor und erworbene Neuropathien sind (ggf. entsprechend den Leitlinien der Fachgesellschaften, für Erwachsene aktuell gültige Leitlinie der Deutschen Gesellschaft für Neurologie (DGN): Diagnostik bei Polyneuropathie) mindestens soweit ausgeschlossen, wie durch nicht-invasive Untersuchungen möglich.
Degenerative neurologische Erkrankungen	Es ist eine fachärztliche neurologische Untersuchung erfolgt. Ein schriftlicher Bericht dokumentiert Krankengeschichte, Neurostatus, Familienanamnese.	Ausschluss einer Repeat-Expansion im FXN-Gen (Friedreich-Ataxie) wenn kein Hinweis auf dominant erbliche Erkrankung
	Erworbene Ursachen und nicht-degenerative Ursachen der führenden Symptomatik sind ausgeschlossen worden (beispielsweise Tumor und Kompressionssyndrom, Durchblutungsstörung, Entzündung).	Ausschluss von  SCA1, SCA2, SCA3 und SCA6 (CAG-Repeat-Expansion) bei Hinweis auf dominant erbliche Erkrankung
	Die Erkrankung ist klinisch progredient	Ausschluss einer Mutation im SPAST-Gen (Sanger-Sequenzierung und Gendosis) bei Verdacht auf erbliche Paraplegie
		Ausschluss der GAG-Deletion im TOR1A-Gen (DYT1) bei Verdacht auf eine erbliche Dystonie
		Ausschluss einer PARK2-Mutation (Sequenzierung und Gendosis) bei Verdacht auf eine erbliche Parkinson-Erkrankung (in der Familie muss ein weiterer Erkrankungsfall mit idiopathischer Parkinson-Erkrankung dokumentiert sein)
Kognitive Entwicklungs-störung (geistige Behinderung) mit oder ohne Fehlbildungen	Es ist eine neuropädiatrische Untersuchung erfolgt. Ein schriftlicher Bericht dokumentiert Krankengeschichte, Neurostatus, Familienanamnese. Die Voraussetzung für die Berechnungsfähigkeit der GOP 11500 sind erfüllt	vor NGS obligat Array-CGH zum Ausschluss ursächlicher CNV und Untersuchung auf Fragiles X-Syndrom
	Liegt ein Hinweis auf eine X-gekoppelte Erkrankung vor (männlicher Indexpatient und Mutter mit signifikant verschobener X-Inaktivierung bzw. mehrere männliche Patienten in der mütterlichen Linie) sollte unabhängig von der angereicherten Genliste eine Auswertung X-gekoppelter Retardierungsgene (inklusive Gendosisanalyse für hemizygote Exon-Deletionen) erfolgen.
	Ausschluss einer exogenen (i.e. infektiösen, immunologischen, traumatischen, anderen metabolischen oder genetischen) Genese und die Indikationsstellung durch Neurologen, Neuropädiater oder Humangenetiker mit schriftlichen Dokumentation (Krankheitsverlauf, Familienvorgeschichte)
Mitochon-driopathien	Leigh-Syndrom bei Kindern oder Erwachsenen
	Mitochondriale Enzephalomyopathie mit oder ohne Beteiligung anderer Organe (Herz, Leber, etc)	Ausschluss einer Mutation in SURF1 und MTATP6
	Chronisch Progressiv Externe Ophthalmoparese (CPEO)	Ausschluss einer Mutation in POLG
	Infantile Laktatazidose	Ausschluss einer Mutation in POLG und singulären MT-DNA Deletion
	Mitochondriale Kardiomyopathie	Ausschluss einer Mutation in PDAH1, MTATP6, SURF1 und PDH1
	Mitochondriale Hepato(enzephalo)pathie	Ausschluss einer Mutation SCO2, TAZ und AARS2
	Defekt der Atmungskettenkomplexe I, II, III, IV, V oder Pyruvatdehydrogenase	Ausschluss einer Mutation in POLG und DGOUK
	Defekt der Coenzym Q10 Biosynthese	Ausschluss einer Mutation in ADCK3 und ETFDH